医院在实施HIS的过程中，着重处理好以下几个方面的事情：

1．   明确与软件公司的合作关系，要有心理准备：必要时工作流程再造。

医院选择公司多是从应用软件的功能及公司的规模、水平、管理等方面考虑。无外乎两种情况：一种是无论公司规模怎样，可以为医院“量身定做”一套基本与医院现行运行模式一致的HIS系统；一种是公司已经有基本成形的应用系统，用户数量也较多，医院拿来或简单修改即可实施。医院一般都是千挑万选才找到一家自己满意的公司的。此时医院的利益与公司的利益都是密切相关的。医院HIS做好了，公司才会有利益，同样公司有利益、医院的HIS才有保障，否则，只可能两败俱伤，而做不到双赢。具体表现在HIS实施时的需求调研及程序修改上。医院要保证HIS大的运行框架符合医院的管理规定，同时也要注意片面追求某些功能或细枝末节的完善可能会导致系统的不稳定。因为数据库内部的设计及逻辑结构关系是复杂的。对一个已经成熟稳定的系统来说，尽可能不要做大的改动，这一点需要院方与开发公司共同认识到位。另外如果HIS本身的流程可取，医院也可以取其长，重新流程再造，顺应HIS。
2．   组织医院科室与公司协作配合

医院的需求应该统一汇总，提交给实施公司，双方要有记录。并针对每一次修改进行落实。避免院方工作人员私下接触开发、实施工程师，同时实施人员也应避免接受未经院方授权的个人的修改意见和建议。

3．   做好基础数据准备工作。

针对应用程序，院方组织职能科室如医务科、医保科、药剂科、经管科、人事科、门诊部等进行数据字典的维护，这种维护一是为系统的正常运行提供基础保证，另一方面也是提前熟悉系统、提前掌握功能，尽早进入情况。为日后的维护工作做好准备。医院升级HIS存在数据切换，院方人员要配合工程师进行数据准备。了解新系统的数据结构，将原有系统的数据按新的结构导出，再由工程师导入新的系统。在基础数据准备完毕后要请各科室进行校对、检查，以免运行后因数据错误导致运行不正常。同时要分清各科的责任和义务，如药剂科维护新的药品信息、经管科维护新的收费信息后都要通知医保科维护医保比例等等。

4．   组织医院员工培训

按员工的角色不同有序地组织培训，培训过程不仅是模块功能的介绍和使用，还包括整个流程的说明及各种问题的处理。升级或换系统时大家都有“恋旧”心理，总会比较新旧的差别，会提出一些要求按旧的如何如何做，此时要该强硬的强硬，保证应用流程得到较好的贯彻。

   但这种强硬是建立在医院已经协调各科室统一考虑之后的。

5．   做好应急方案

任何系统的实施都不可能完全准确无误，都有意外的发生，提前做好应急预案的工作，既是防患于未然，也同时在实施之前将各种意外的发生可能性降低到最小。从硬件和软件两个方面考虑主要包括：1、服务器、网络交换机、供电等的安全保障，计算机、读卡器及其他配件的额外准备；软件故障时的灵活策略等。